Validità della fissazione con formalina dei campioni di tessuto per la determinazione del profilo di espressione del genoma e dell’associazione tra la firma di espressione genica nei tessuti circostanti il tumore e la sopravvivenza dei pazienti con epatocarcinoma
La sfida del momento è quella di identificare i pazienti che, dopo trattamento potenzialmente curativo per l’epatocarcinoma (HCC), sono a più alto rischio di recidiva. Perché proprio questi pazienti potrebbero essere sottoposti ad interventi innovativi. Un ostacolo allo sviluppo di fattori predittivi degli outcome nei pazienti con HCC, che i ricercatori dei maggiori centri mondiali di oncologia hanno osservato, è stata l’insufficiente spinta a definire il profilo di espressione dell’intero genoma in tessuti ‘fissati’ con formalina (ed inclusione in paraffina), rispetto ai campioni congelati. I risultati dello studio, pubblicato nel New England Journal of Medicine (leggi abstract originale), hanno indicato la possibilità di definire il profilo di espressione genica in più di 6000 geni umani. Il metodo è stato applicato a tessuti ottenuti da 307 pazienti con HCC per definire e convalidare l’associazione tra firma di espressione genica e sopravvivenza. Il metodo per definire il profilo di espressione in tessuti ‘fissati’ è risultato altamente efficace: i campioni derivati dal 90% dei pazienti hanno dimostrato una qualità ottima, inclusi quelli conservati per più di 24 anni. Se i profili di espressione genica di tessuto tumorale non hanno raggiunto la significatività per l’associazione con la sopravvivenza, quelli di tessuto epatico normale adiacente alla massa tumorale ottenuti da 82 pazienti giapponesi hanno mostrato una forte correlazione con la sopravvivenza e la firma di espressione genica è stata validata su tessuti provenienti da un gruppo indipendente di 225 pazienti statunitensi ed europei (p = 0.04).Liver Cancer Newsgroup – Numero 1 – Gennaio 2009